存储引擎原理简述


1 MARS2 概述

MARS2 存储引擎主要是面向数据高速加载和查询而设计的,其内部采用有序存储省却搜索。

1.1 内部原理

MARS2 表与 MARS3 相同,也采用 LSM Tree 结构存储。

MARS2 内部原理图如下:

我们将以概念逐层剖析的形式来解读上图。

1.1.1 排序键

  • MARS2 中,数据是有序存储的,在创建表时,需要通过创建索引的方式制定排序的顺序。 这个排序顺序涉及的字段,称为排序键。
  • 排序键只能指定一次,不能修改,不能删除。
  • 为了最大化利用顺序性带来的性能提升,最好选择经常使用且过滤效果好的字段作为排序键。比如设备监控表,可以采用事件时间戳和设备 ID 作为排序键。
  • 如果排序键是文本类型,且能接受按照字节顺序排序,那么在这个列采用 COLLATE C 能够加速排序。

1.1.2 Run 和元信息

  • 根据排序键,MARS2 中存储的数据是有序的,一段连续有序的数据称为 Run
  • 为了能够找到 Run 存储在哪里,会记录 Run 的存储位置,称为 Run 的元信息。
  • 同时,元信息还记录 Run 的最小最大值,这样可以在查询时进行过滤。
  • 插入数据时,会先在内存中对数据进行排序,因此 Run 的大小受制于排序内存大小。

1.1.3 合并

  • Run 中如果数据范围有重叠,则会造成读放大,降低查询效率。因此,当磁盘上的 Run 数量超过一定值时,MARS2 会将磁盘上的多个 Run 加载到内存,进行排序,最后输出为一个 Run。这个过程称为合并
  • 合并过程中,数据依然可读可写:
    • 读数据时,只会读合并的输入文件
    • 写数据时,合并过程不会读新写入的数据
    • 读,写,合并三者之间不会互相阻塞

1.1.4 Level

  • 为了让合并的输入文件尺寸相近(避免超大文件与小文件合并),Run 被组织到 Level 中,有 3 层:L0,L1,L2
  • 当数据合并完超过一定大小就会升级到更高的 Level 去,过程如下:
    • 1.新插入的数据在 L0,当 Run 数量达到一定数量时(可配置,见配置参数 mars2_automerge_threshold),触发 L0 合并,将 L0 所有的 Runs 合并为一个 Run。
    • 2.如果结果 Run 大小超过 25MB(可配置,见配置参数 level0_upgrade_size),则将其升级到 L1。
    • 3.如果升级到 L1 后,L1 的 Run 大小之和超过 1000MB(可配置,见 level1_upgrade_size),则触发合并,L1 的所有 Runs 合并为一个 Run。
    • 4.如果结果 Run 大小超过 1000MB(可配置,见 level1_upgrade_size),则将其升级到 L2。
    • 5.到达 L2 之后的 Run 不再合并。

1.1.5 列存

  • MARS2 采用列存方式存储数据,访问磁盘时只需要访问用到的列,这样减少了 I/O。
  • 同一列数据类型相同,更容易进行压缩,节省磁盘空间。
  • 另外,列式存储适合于向量化执行,可以大幅加速查询执行速度,具体见向量化执行引擎

1.1.6 MINMAX 过滤

  • 前面提到了 Run 的元信息存储了最小最大值,用于在查询时进行过滤。
  • 因为是通过元信息进行过滤,不需要加载数据本身,相比于顺序扫描(先访问数据本身,再进行过滤)其 I/O 开销更低,能更快的进行过滤。
  • 使用 MARS2 建表时不会默认记录最小最大值,需要显式声明

首先创建 matrixts 扩展:

=# CREATE EXTENSION matrixts ;

显式声明记录最小最大值。

=# CREATE TABLE metrics (
    ts              timestamp   ENCODING(minmax),
    dev_id          bigint      ENCODING(minmax),
    power           float,
    speed           float,
    message         text
) USING MARS2;

创建 mars2_btree 索引。

=# CREATE INDEX ON metrics
USING mars2_btree (ts, dev_id);
  • 排序键和非排序键都可以定义 MINMAX,定义在排序键上时效果更为显著,表达式中 MINMAX 全部大写或全部小写均可。
  • 另外,最多只能给 32 个列定义 MINMAX。

1.1.7 MARS2 Btree 索引

  • 除了 MINMAX,MARS2 还内置了一个索引(即建表时创建的索引)。
  • 目前只能定义一个索引,即只能有一个全局排序
  • 与普通 Btree 索引不同,MARS2 Btree 索引:
    • 是稀疏的,因此尺寸更小
    • 由于数据本身是有序的,因此不存在索引扫描产生的随机 I/O

1.1.8 压缩

同 MARS3。

  • 默认情况下,所有的数据列,采用 lz4 进行压缩。
  • 支持手动指定编码链压缩算法,可以整个表指定,也可以单个列指定。

1.1.9 数据写入

  • 数据通过 INSERT 写入到内存中,之后经历这些过程,生成一个 Run。
  • 如果插入数据量较大,超过了排序内存,则会生成多个 Run。
  • 排序内存的大小是可以配置的,详见 "1.2.2 配置项"。

1.1.10 更新和删除

  • MARS2 暂时不支持更新和删除。
  • 更新操作可以用 Unique Mode 代替更新操作。
  • 删除操作只能通过删除或者 TRUNCATE 分区表完成。

1.2 MARS2 使用

1.2.1 创建 MARS2 表

已创建 matrixts 扩展的前提下,最简洁的建表方式,只需要在 CREATE TABLE 语句加上 USING 子句,并创建索引即可。延伸示例请见表设计最佳实践

=# CREATE TABLE metrics (
    ts              timestamp,
    dev_id          bigint,
    power           float,
    speed           float,
    message         text
) USING MARS2;

=# CREATE INDEX ON metrics
USING mars2_btree (ts, dev_id);

1.2.2 配置项

注意!
下述内容中表级配置项,指的是只能在创建数据表时使用 WITH 子句配置,适用于单表,且一旦配置便无法修改的配置项。全局配置项指的是可在会话或系统级别配置,系统级别的修改需要执行 mxstop -u 才能生效的配置项。更多信息请见 数据表配置参数

以下几个参数用于控制合并(Merge),其影响合并的方式见上文 Level 部分。

合并控制参数 单位 默认值 取值范围 描述
mars2_automerge_threshold run 32 10 - 2048 用于控制 所有 的 MARS2 表,L0 达到多少个 Run 触发合并,为全局配置项。如果要为表单独指定可以使用表选项 level0_merge_threshold
level0_merge_threshold run 32 1 - 2048 用于控制单表 L0 达到多少个 Run 触发合并,为表级配置项
level0_upgrade_size MB 25 1 - 10000 控制单表 L0 -> L1 升级的大小,当 L0 发生合并后结果 Run 超过这个大小将升级到 L1,为表级配置项
level1_upgrade_size MB 1000 1 - 10000 控制单表 L1 -> L2 升级的大小,当 L1 发生合并后结果 Run 超过这个大小将升级到 L2,为表级配置项
  • 如果每次插入较少的数据(每次插入对应一个 Run),很快就会触发 Merge,这种 Merge 效率不高。此时可以调高 mars2_automerge_threshold / level0_merge_threshold 提高 Merge 输入的 Run 数量,降低 Merge 的频率。
  • 当 L0/L1 的 Merge 输出不到升级到 L1 的大小,下一轮的 Merge 会将其与新的 Run 进行合并,导致写放大。为了避免这种情况,可以降低 level0_upgrade_size / level1_upgrade_size 使得其升级到下一层。

以下参数用于压缩控制,调节压缩效果,如果配置过低压缩效果不明显,配置过高消耗内存较多。

压缩控制参数 单位 默认值 取值范围 描述
compress_threshold 元组 1200 1 - 100000 压缩阈值。用于控制单表多少元组(Tuple)进行一次压缩,是同一个单元中压缩的 Tuple 数上限,为表级配置项

以下参数用于内存控制。这部分参数控制插入数据时,使用的排序内存的大小,当有多张分区表被插入时,每个分区表会分配 mars2_sort_mem_core 配置的内存;如果不够用则扩大,但总量不会超过 mars2_sort_mem

排序内存参数 单位 默认值 取值范围 描述
mars2_sort_mem KB 2097152KB(2GB) 128KB - 2147483647KB (~ 2048GB) 控制每一个单个插入的排序内存大小,如果插入目标表是分区表,它们将共享这个大小,为全局配置项
mars2_sort_mem_core KB 16384KB(16MB) 128KB - 2147483647KB (~ 2048GB) 控制每一个单个分区表至少分配多少排序内存,为全局配置项

表配置项示例:

=# CREATE TABLE metrics (
    ts              timestamp,
    dev_id          bigint,
    power           float,
    speed           float,
    message         text
) 
USING MARS2
WITH (compress_threshold=1200,level0_merge_threshold=32);

=# CREATE INDEX ON metrics
USING mars2_btree (ts, dev_id);

全局配置项在会话级别修改值示例:

=# SET mars2_sort_mem TO 2097152;

全局配置项在系统级别修改值示例:

=# gpconfig -c mars2_sort_mem -v 2097152
=# \q
$ mxstop -u

2 HEAP 概述

HEAP 是 YMatrix 的默认存储引擎,又称作堆存储,从 PostgreSQL 继承而来,只支持行存储,不支持列存储及压缩,支持分区表。它基于 MVCC 机制实现,适用于有大量更新、删除需求的场景。

2.1 使用 MVCC 机制

MVCC(Multiversion Concurrency Control)机制通常被称为多版本管理。它的核心是对数据的更新、修改和删除处理。
多版本管理中,数据的更新和删除并不一定会在原数据上进行修改,而是需要创立一个新的版本,把原数据标记为失效的数据,再在新版本上增加新数据,数据具有多个版本。每个数据带有一个版本信息,且历史版本均会被保存。
在 MVCC 机制影响下,HEAP 表在处理更新和删除操作的时候,并没有真正删除数据,而只是依靠数据版本信息屏蔽了老的数据(控制了数据的可见性)。因此,HEAP 表大量进行更新或删除操作,占用的物理空间会不断增大,需要你有计划地定期清理老数据。

2.2 HEAP 使用

你可以运用以下 SQL 语句在 YMatrix 中创建一个 HEAP 表。

=# CREATE TABLE disk_heap(
    time timestamp with time zone,
    tag_id int,
    read float,
    write float
)
DISTRIBUTED BY (tag_id);

3 AO 概述

以 AOCO、AORO 为存储引擎的表统称为 AO(Append-Optimized)表,又称作追加优化表,可以支持插入、更新与删除操作,支持压缩。
AORO 支持行存储,AOCO 支持列存储。
AO 表无论是在表的逻辑结构还是物理结构上,都与 HEAP 表存在很大的不同。如上节所述 HEAP 表使用 MVCC 机制控制更新及删除操作后数据的可见性,而AO表则使用一个附加的 bitmap 表来实现,这个表的的内容就是表示 AO 表中哪些数据是可见的。 对于有大量更新及删除操作的 AO 表,同样需要计划地定期清理老数据,不过在AO表中,清理数据工具 vaccum 需要对 bitmap 进行重置并压缩物理文件,因此通常比 HEAP 进度慢。

注意!
MARS2、HEAP、AO 存储引擎详细信息、使用及最佳实践请见表设计最佳实践